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1979年至1982年，他在西安医学院攻读研究生。1982年至1985年在北京医学院病理生理教研室担任教师。1985年至1987年受邀到美国埃默里大学药理系担任访问学者。在美国，他先是从事神经肽Y（NPY）的研究，取得了令人刮目相看的成果。随后转到α1－肾上腺素受体（α1－AR）亚型研究中，在国际上首先证实了α1－AR包括A、B两种亚型，引起巨大反响。1987年，他谢绝许多美国教授的邀请，回国开始白手起家地创建实验室。刚开始的时候，他们只有一间十几平方米的房间，唯一的仪器是借来的一台多导生理记录仪。几年后，这个试验室已经有一千平方米面积，上千万元固定资产，数百万元科研基金。 在从事科研工作的同时，韩启德开始担任行政职务。他先后担任北京医科大学副校长、北京大学常务副校长、九三学社中央主席、欧美同学会理事会会长等。2003年3月在十届人大一次会议上当选全国人大常委会副委员长。2006年5月当选为中国科协主席。  
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